I pastori australiani potrebbero essere colpiti dalle seguenti (ma non limitate a) condizioni di salute e malattie, alcune delle quali ereditarie. Non sono tutte condizioni di salute e malattie ad alto rischio per i pastori australiani. Alcuni di loro sono malattie ambientali, quindi possono essere facilmente evitate prestando cure e attenzioni adeguate ai pastori australiani.