I grandi pirenei potrebbero essere colpiti dalle seguenti (ma non limitate a) condizioni di salute e malattie, alcune delle quali ereditarie. Non sono tutte condizioni di salute e malattie ad alto rischio per i Grandi Pirenei. Alcuni di loro sono malattie ambientali, quindi possono essere facilmente evitate dando ai Grandi Pirenei cure e attenzioni adeguate.
