I cani Havanese potrebbero essere colpiti dalle seguenti (ma non limitate a) condizioni di salute e malattie, alcune delle quali sono ereditarie. Non sono tutte condizioni di salute e malattie ad alto rischio per i cani Havanesi. Alcuni di loro sono malattie ambientali, quindi possono essere facilmente evitate dando ai cani Havanese cure e attenzioni adeguate.