Shiba inus potrebbe essere influenzato dalle seguenti (ma non limitate a) condizioni di salute e malattie, alcune delle quali sono ereditarie. Non sono tutte condizioni di salute e malattie ad alto rischio per Shiba inus. Alcuni di loro sono malattie ambientali, quindi possono essere facilmente evitate dando a Shiba inus cure e attenzioni adeguate.