I rettili hanno un sistema respiratorio unico che si è evoluto nel corso di milioni di anni. Hanno polmoni, ma non sono complessi come quelli dei mammiferi o degli uccelli. Invece di avere un polmone grande, i rettili ne hanno due più piccoli situati su entrambi i lati del cuore. Questi polmoni sono riempiti d'aria attraverso la trachea, che è un tubo che collega i polmoni alla bocca e al naso.
I polmoni dei rettili sono rivestiti da minuscole sacche d'aria chiamate alveoli. Questi alveoli sono i luoghi in cui avviene lo scambio di gas. L'ossigeno presente nell'aria viene assorbito nel flusso sanguigno attraverso gli alveoli, mentre l'anidride carbonica viene rilasciata dal flusso sanguigno nei polmoni.
I rettili hanno anche un organo speciale chiamato glottide, che si trova nella parte posteriore della gola. La glottide controlla il flusso d'aria dentro e fuori i polmoni. Quando la glottide è aperta, l’aria può entrare e uscire dai polmoni. Quando la glottide è chiusa, l’aria non può entrare nei polmoni.
I rettili usano i polmoni per respirare, ma usano anche la pelle per assorbire l'ossigeno. La pelle dei rettili è sottile e ricoperta di scaglie che consentono il passaggio dell'ossigeno. Ciò significa che i rettili possono assorbire ossigeno dall’aria che li circonda, anche quando non respirano.